اختر در زمینه‌های فلسفهٔ اسلامی، فلسفهٔ دین، تفسیر قرآن، رابطهٔ اسلام و مسیحیت و مواجههٔ ادیان با سکولاریسم مدرن پژوهش می‌کرد. او همچنین به بررسی آثار سورن کی‌یرکگور و مسائل مربوط به آزادی بیان، وجدان و ایمان علاقه داشت