تحقیقات شخصیت های اصلی داستان درباره مرگ های مرموز در صومعه، هرچه بیشتر با کتابخانه صومعه ارتباط می یابد.
برجستهترین مضمون در رمان «کیمیاگر» این ایده است که هر انسان دارای یک «افسانه شخصی» است.