فیلیپ هافمان در دانشگاه آزاد برلین در رشته فیزیک تحصیل کرد و پژوهش‌های دوره دکتری خود را در «موسسه فریتس-هابر» وابسته به انجمن ماکس پلانک (که آن نیز در برلین واقع است) به انجام رساند. او به عنوان پژوهشگر بورسیه «فئودور لینن» (از سوی بنیاد الکساندر فون هومبولت) مدتی را در آزمایشگاه ملی اوک ریج در ایالات متحده گذراند. وی در سال ۱۹۹۸ به دانشگاه آرهوس در دانمارک پیوست و هم‌اکنون در دپارتمان فیزیک و نجوم این دانشگاه، استاد است.